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Mémoire de Maîtrise
DOI
https://doi.org/10.11606/D.42.2016.tde-16082016-135134
Document
Auteur
Nom complet
Jennifer Katherine Salguero Londoño
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2016
Directeur
Jury
Araujo, Welington Luiz de (Président)
Galhardo, Rodrigo da Silva
Silva, Aline Maria da
Titre en portugais
Análises da expressão de genes do sistema de secreção na interação Methylobacterium mesophilicum SR 1.6/6 com a planta hospedeira.
Mots-clés en portugais
Bactéria metilotrófica
Expressão gênica
Exsudatos
Interação planta-micro-organismo
PCR em tempo real
Resumé en portugais
O gênero Methylobacterium é composto por bactérias de coloração rósea, metilotróficas e que podem colonizar endofiticamente a planta. Algumas espécies deste gênero são capazes de promover o crescimento vegetal e reduzir o ataque de fitopatógenos. A linhagem de M. mesophilicum SR1.6/6 foi isolada de ramos de citros e devido a sua interação com a planta hospedeira e com patógenos associados a planta, tem sido foco vários trabalhos. Os sistemas de secreção e as bombas de efluxo podem estar envolvidos na modulação das interações de bactérias endofíticas com seus ambientes. Assim, neste estudo foi analisada a composição dos exsudatos produzidos pelas plantas de milho e citros na interação com a SR1.6/6 por GC-MS, foi realizada a reanotação de genes relacionados ao sistema de secreção e bombas de efluxo e foi avaliada a expressão de alguns genes destes sistemas na interação com Zea mays e Citrus sinensis por qPCR. Foram encontrados sistemas de secreção tipo I, II e V, vias SEC e TAT e bombas de efluxo, principalmente super-expressos durante a interação com a planta hospedeira.
Titre en anglais
Gene expression analysis of secretion system during interaction of Methylobacterium mesophilicum SR 1.6/6 with the host plant.
Mots-clés en anglais
Gene expression
Methylotrophic bacteria
Plant-bacteria interaction
qPCR
Root exsudates
Resumé en anglais
Methylobacterium genus is composed by pink-pigmented facultative methylotrophic bacteria. Some species of this genus are able to promote plant growth and reduce the incidence of pathogens. The SR1.6/6 strain of Methylobacterium mesophilicum is a bacterium isolated from citrus and due to its interaction with the plant has been the focus of several studies. Multidrug efflux pumps and secretion system can be involved modulating the interactions of bacteria with their environments. In this work was analised the root exsudates composition from two host plants citrus and corn interacting with SR1.6/6 by GC-MS technique, additionally was searched and reannotated genes related to secretion system and some multidrug efflux pumps and finally evaluated the gene expression of some of this genes during the interaction with Zea mays and Citrus sinensis by qPCR. Type I, II and V secretion system, SEC and TAT pathway and some multidrug efllux pumps were found in this strain according gene expression. This systems were up-regulated mainly during interaction with host plant.
 
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Date de Publication
2016-08-16
 
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