Energy sugarcane has emerged as a significant resource of biomass for several countries, offering promising potential for the production of biofuels and other industrial products. To date, no genomes or transcriptomes of this crop have been reported, especially regarding interaction with the fungus Sporisorium scitamineum or other pathogens. The fungus S. scetamineum is one of the main pathogens that attack energy cane, causing significant impacts on yield. A good amount of information is available in the interaction between the pathogen and sugarcane, but much is needed to understand the interaction of the pathogen with energy cane. In order to shed some light in this interaction, two de novo assembly of the transcriptome of susceptible Vertix 1, and resistant Vertix 2 genotypes of energy cane was assembled with RNA-seq data obtained from energy cane buds 48 hours post inoculation (48hpi). Comparative analyses were conducted using both de novo transcriptomes, modern sugarcane cultivars, and related species. Additionally, a differential expression analysis was performed. We identified that despite energy cane presenting similarities with modern sugarcane cultivars and the species S. officinarum and as the defense responses are similar to those observed in interactions between sugarcane and S. scitamineum, it still has its own characteristics. These results bring important insights on the energy cane - S. scitamineum interaction.

A cana energia, ao contrário da cana-de-açúcar convencional, foi selecionada para ter um maior teor de fibra do que sacarose. Nas últimas décadas, o cultivo de cana-energia aumentou devido ao grande potencial da cultura para a produção de energia renovável, possibilitando a redução na dependência de combustíveis fósseis e nos impactos ambientais causados por esses. Até o momento, nenhum genoma ou transcriptoma desta cultura foi relatado, principalmente no que diz respeito à interação com o fungo Sporisorium scitamineum ou outros patógenos. O S. scetamineum é um dos principais patógenos que atacam a cana energia, causando impactos significativos na produtividade. Há informações disponíveis na interação entre o patógeno e a cana-de-açúcar, mas muito é necessário para entender a interação do patógeno com a cana energia. A fim de lançar alguma luz nesta interação, foi realizado duas montagens de novo do transcriptoma de genótipos Vertix 1 suscetíveis e Vertix 2 resistentes de cana-energia com dados de RNA-seq obtidos de gemas de cana-energia 48 horas após a inoculação (48hpi). Análises comparativas foram conduzidas utilizando os transcriptomas de novo de ambos os genótipos, cultivares modernas de cana-de-açúcar e espécies relacionadas. Além disso, foi realizada uma análise de expressão diferencial. Identificamos que a cana energia apresenta semelhanças com cultivares modernas de cana-de-açúcar e com a espécie S. officinarum e as respostas de defesa são semelhantes às observadas nas interações entre cana-de-açúcar e S. scitamineum. No entanto, ela ainda possui características próprias. Esses resultados trazem informações importantes sobre a interação cana-energia x S. scitamineum.