Compreender a diversidade do germoplasma, bem como o parentesco e similaridade genética entre os genótipos elite de programas de melhoramento genético, desempenha um papel fundamental na formulação de estratégias de melhoramento florestal. Vários métodos estão atualmente disponíveis para análise da composição genética de bancos de acessos de germoplasma, linhagens e populações. Esses métodos se baseiam em informações sobre o pedigree, características morfológicas, dados de produtividade, dados bioquímicos e, mais recentemente, dados moleculares baseados em DNA. Nesta dissertação, foi estudada a estrutura e diversidade genética de uma população de melhoramento genético de Eucalyptus spp. da empresa Bracell. Indivíduos oriundos de um dialelo completo foram genotipados com chip de genotipagem da Thermo Fisher composto por 72.000 SNPs previamente otimizados para capturar polimorfismos em indivíduos desse gênero. Esses indivíduos têm origem em quatorze genitores, que são híbridos de Eucalyptus urophylla com Eucalyptus grandis, além de espécies puras de Eucalyptus grandis e Eucalyptus urophylla. Rotinas de bioinformática e modelos estatísticos foram utilizados para caracterizar a população de melhoramento. O estudo foi realizado por meio da Análise de Componentes Principais (PCA) e pelo método de mistura genética (admixture), utilizando o software Structure. Um teste de paternidade foi conduzido para verificar a conformidade entre os genitores registrados nos pedigrees e a composição genética das progênies. Nos casos de incongruência, genitores mais compatíveis geneticamente com as progênies foram sugeridos. A análise de PCA revelou dois grupos genéticos distintos entre os genitores: um contendo treze dos catorze genitores e seus respectivos descendentes, enquanto o outro consistiu apenas de um genitor e seus descendentes resultantes de autofecundação. Esta estruturação possibilitou a formação de um terceiro grupo, composto por descendentes dos cruzamentos entre os dois grupos de genitores. A análise conduzida com o método admixture identificou a presença de três grupos genéticos distintos entre os genitores, com um genitor pertencente em cada um dos três clusters, sem apresentar mistura. Dentre os onze genitores restantes, cinco genitores formaram um grupo com uma predominância do terceiro cluster genético. Os demais genitores apresentaram proporções semelhantes entre o terceiro e o segundo cluster, mas todos exibiram uma proporção muito baixa do primeiro cluster. Os padrões genéticos dos descendentes são consistentes com os dos genitores, as proporções dos clusters se repetiram. Os testes de paternidade indicaram que os descendentes do genitor materno denominado G02 possui genitores paternos diferentes dos documentados em seus pedigrees, e que os genitores paternos G10 e G06 devem ser substituídos pelos genitores paternos G08 e G11 nos cruzamentos com o genitor materno G07, respectivamente. Também se constatou que as progênies consideradas anteriormente oriundas da autofecundação de G10 são, na verdade, resultado de um cruzamento entre G10 e G8. Tais possíveis equívocos no pedigree são relativamente comuns em programas de melhoramento genético florestal, tendo em vista a possibilidade de contaminação de pólen e erros na identificação das sementes. Os resultados deste estudo desempenharão um papel importante na orientação das decisões destinadas a aprimorar o programa de melhoramento genético da empresa, garantindo que as escolhas feitas no presente estejam alinhadas com os objetivos de longo prazo.

Understanding germplasm diversity, as well as the relatedness and genetic similarity among top genotypes from genetic improvement programs, plays a key role in developing forestry and agronomic crop improvement strategies. Several methods are currently available for analyzing the genetic makeup of germplasm accession banks, lines and populations. These methods are based on pedigree information, morphological traits, yield data, biochemical data and, more recently, DNA-based molecular data. In this work, the structure and genetic diversity of a genetic improvement population of Eucalyptus spp. were studied, based on data from the company Bracell. Individuals originating from a complete diallel were genotyped with a Thermo Fisher genotyping chip composed of 72,000 SNPs previously optimized to capture polymorphisms in individuals of this genus. These individuals originated from fourteen parents, which are hybrids of Eucalyptus urophylla and Eucalyptus grandis, in addition to species of Eucalyptus grandis and Eucalyptus urophylla. Bioinformatics routines and statistical models were used to characterize the breeding population. The study was carried out using Principal Component Analysis (PCA) and the genetic mixture method (admixture) in the Structure software. A paternity test was conducted to verify conformity between the parents registered in the pedigrees and the genetic composition of the progenies. When incongruity was detected, parents who were more genetically compatible with the progenies were suggested. PCA analysis revealed two distinct genetic groups among the parents: one containing thirteen of the fourteen parents and their respective descendants, while the other consisted of only one parent and its descendants resulting from self-fertilization. This structuring enabled the formation of a third group, composed of descendants of crosses between the two groups of parents, positioning themselves intermediately in the PCA space. The analysis conducted by the admixture method identified the presence of three distinct genetic groups among the parents, with one pure parent in each of Clusters 1, 2 and 3 respectively. The remaining eleven parents showed mixture, with a predominance of Cluster 3, followed by Cluster 2 and Cluster 1. The genetic patterns of the descendants are consistent with those of the parents, as among the sixty crosses carried out, only four resulted in descendants without genetic mixture. Paternity tests indicated that the descendants of G02 and G12 have different paternal parents than those registered in their pedigrees, and that parents G10 and G06 should be replaced by parents G08 and G11 in their crosses with parent G07, respectively. Progenies previously considered the result of self-fertilization of parent G10 were identified as crosses between G10 and G8. Such mistakes in the pedigree are relatively common in forestry genetic improvement programs, given the possibility of pollen contamination and errors in seed identification. The results of this study will play an important role in guiding decisions aimed at improving the company's genetic improvement program, ensuring that choices made today are in agreement with long-term objectives.