Os princípios básicos do melhoramento de plantas têm sido desenvolvidos principalmente para as espécies autógamas e alógamas, sendo escassa a base teórica para o melhoramento das espécies parcialmente autógamas. Neste trabalho investigaram-se a estrutura genética e critérios de seleção no cultivar de algodoeiro CNPA 3H, considerando a sua autogamia parcial. Para isso avaliaram-se, em Campinas-SP, em 1986/87, 75 progênies autofecundadas (AF) e 75 de polinização livre (PL) obtidas aos pares de 75 matrizes. Em 1987/88 repetiu-se o processo avaliando-se 54 AF e 54 PL. Foram estimados os componentes da variância genotípica (descrito tese) e o progresso genético através das seguintes covariâncias entre parentes: mãe e filhas_AF; mãe-filhas_PL; irmãs_AF; irmãs_PL e irmãs_AF,PL. Estudaram-se o rendimento de algodão em caroço, os componentes da produção e caracteres tecnológicas da fibra. Os principais resultados e conclusões mostraram que, o cruzamento natural encontrado (28,6%), dificulta a obtenção e manutenção de um cultivar de algodoeiro agronomicamente superior, homozigótico e estável. O coeficiente médio de endogamia (0,56) demonstrou a condição parcialmente endogâmica do CNPA 3H. Apesar dessa estrutura genética intermediária em relação às alógamas e às autógamas, a avaliação de vários parâmetros demonstrou que no melhoramento o algodoeiro deve ser tratado mais como as espécies alógamas, pelo menos no início dos programas. A depressão endogâmica verificada no rendimento (11,2%), no peso do capulho (12,5%), no peso de cem sementes (7,1%) e no comprimento da fibra (3,2%), indicou que a dominância gênica associada à heterozigose é um fator de dificuldade na seleção. A maior variância (descrito tese) entre progênies AF indicou que a seleção entre estas é superior à seleção em PL. Entretanto, a maior variância dentro (descrito tese) de progênies PL mostrou a superioridade destas para a seleção individual. As covariâncias usadas permitiram a estimação das componentes de (descrito tese). Na maioria dos caracteres detectou-se variância genética aditiva (descrito tese). A componente (descrito tese), apresentou-se com a maioria dos valores negativos e de magnitudes superiores aos de (descrito tese) em valores absolutos, o que não é esperado. Por essa razão, as estimativas do progresso imediato e a longo prazo foram negativas ou negligíveis. A expectativa de ganho genético elevado, baseando-se apenas nos valores de (descrito tese), mostrou ser um processo enganoso nas espécies parcialmente autógamas, uma vez que nestas o progresso depende das demais componentes da variância genotípica. A esse respeito a componente (descrito tese) requer atenção especial, pois mesmo numa população com (descrito tese) significativo, a estimativa de D₁ poderá ser negativa. Isso ocorrerá nas frequências gênicas (p) abaixo de 0,5 (na presença de dominância positiva) ou com p > 0,5 (com dominância negativa). Nessas condições o progresso genético poderá ser negligível, dependendo da magnitude de (descrito tese). Devido a essas propriedades e visando aumentar a eficiência do melhoramento, deve-se evitar os possíveis efeitos negativos de (descrito tese). Isso pode ser conseguido efetuando-se seleção recorrente no início do programa, antes da obtenção de genótipos superiores através dos processos que incrementam a endogamia, como se faz no algodoeiro. A seleção recorrente possibilitaria o aumento da frequência gênica da população, o que minimizará possíveis valores negativos de (descrito tese). O delineamento genético utilizado não foi eficiente, tendo acusado problemas de colinearidade na matriz do delineamento x, o que afetou as estimativas das componentes de (descrito tese), principalmente (descrito tese) e (descrito tese) e consequentemente o progresso genético. A avaliação da matriz de outros quatro delineamentos genéticos também acusou o mesmo problema, principalmente com taxas de autofecundação natural superiores a 50%. Esses resultados mostraram que mais investigações são necessárias visando aperfeiçoar a metodologia de obtenção das estimativas das componentes de (descrito tese) no algodoeiro, com autogamia parcial.

The basic principles of Plant Breeding have been developed mainly for self and cross fertilizing species. Consequently, an insufficient amount of information is available to support breeding programs involving mixed self and random mating species. The genetic structure and selection criteria of the cotton cultivar CNPA 3H were investigated considering its partial autogamy. During 1986/87 in Campinas, State of São Paulo, 75 self-fertilized progenies (AF), and 75 open pollinated progenies (PL), obtained in pairs of 75 seed parents were evaluated. In 1978 the same process was repeated, evaluating 54 AF and 54 PL progenies. Components of the genotypic variance (see thesis) and the genetic progress were estimated through the following covariances among relatives: seed parents and self fertilized offspring_AF; seed parent and open pollinated offspring_PL; self fertilized sibs_AF; open pollinated sibs_PL, and self fertilized versus open pollinated sibs_AF,PL. The following traits were considered yield of cotton seed, components of yield and technological properties of fibers. The main results and conclusions demonstrated that, with a natural crossing rate of 28,6,%, obtaining and maintaining an agronomically superior homozygotic and stable cotton cultivar is certainly difficult. The average inbreeding coefficient of 0.56 demonstrated the partial selfing condition of CNPA 3H. In spite of this intermediate genetic structure, in relation to cross and self fertilization, the evaluation of several parameters demonstrated that cotton should be handled more as a cross fertilizing species, in the exploitation of this genetic variance. Inbreeding depression for yield (11.2%), weight of boll (12.5%), weight of 100 seeds (7.1%) and fiber length (3.2%) showed that genetic dominance, associated with heterozygosis, will bring difficulties in selection. The highest genetic variance (see thesis) among AF progenies showed that selection among this type of families will give better results in comparison with the PL progenies. However, the highest variance (see thesis) within PL progenies showed that they are more adequate for individual selection. The covariances used among relatives considered allowed the evaluation of the components of (see thesis) and (see thesis). Additive genetic variance (see thesis) was detected for most traits. The (see thesis) components were generally large and negative and also of greater magnitudes than (see thesis), in absolute value, which is not expected. For this reason, the long and short-term progress estimates were negative or negligible. The expectation of high genetic gains, based only on (see thesis) values, showed that this inference is misleading in species with partial selfing , since progress depends upon the other components of genotypic variance. Hence it could be shown that the (see thesis) component requires special attention, because even in population with significant (see thesis) values, (see thesis) may be negative. This occurs for gene frequencies (p) below 0.5 and positive dominance, or with p > 0,5 and negative dominance. In such conditions the genetic progress may be negligible, depending on the magnitude of (see thesis). Due to such properties possible negative effects of (see thesis) should be avoided, to increase the efficiency of breeding programs. This can be reached through recurrent selection at the beginning of the program. This will increase the probability of obtaining superior genotypes through the usual inbreeding schemes, as done in cotton. Recurrent selection will promote the increase of gene frequency of the population, minimizing the possibility of negative (see thesis) values. The mating design used was not efficient, since problems of colinearity in the design matrix (x) were detected. This affected the estimates of the (see thesis) components, mainly (see thesis) and (see thesis), and consequently the genetic progress. The evaluated of matrix (x) of other four mating designs also indicated the same problem, of mainly when rates of natural self-fertilization are greater than 50%. These results showed that more investigations are necessary in relation to the methodology for estimating (see thesis) components in cotton, with partial selfing.