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Mémoire de Maîtrise
DOI
10.11606/D.17.2018.tde-07062017-100712
Document
Auteur
Nom complet
Lucas Frighetto Pereira
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
Ribeirão Preto, 2016
Directeur
Jury
Barbosa, Marcello Henrique Nogueira (Président)
Herrero, Carlos Fernando Pereira da Silva
Traina, Agma Juci Machado
Titre en portugais
Classificação semiautomática de fraturas vertebrais benignas e malignas em imagens de ressonância magnética
Mots-clés en portugais
Diagnóstico auxiliado por computador
Fratura vertebral por compressão
Imagens de ressonância magnética
Processamento de imagens
Resumé en portugais
Propósito: Fraturas vertebrais por compressão (FVCs) são caracterizadas por colapso parcial de corpos vertebrais. Elas tipicamente ocorrem na população idosa de forma não traumática ou por trauma de baixa energia, podendo ser secundárias a fragilidade causada pela osteoporose (FVCs benignas) ou metástases vertebrais (FVCs malignas). Nosso trabalho tem o objetivo de detectar a presença de FVCs e de classifica-las como FVC maligna ou FVC benigna utilizando técnicas de processamento de imagens e aprendizado de máquinas em imagens ponderadas em T1 obtidas em ressonância magnética (RM). Materiais e Métodos: Foram utilizados os planos sagitais medianos das RMs da coluna lombar de 63 pacientes (38 mulheres e 25 homens) previamente diagnosticados com FVCs. Os corpos vertebrais lombares foram segmentados manualmente. Atributos de análise de níveis de cinza foram calculados do histograma dos corpos vertebrais. Foram extraídos também atributos de textura para analisar a distribuição dos níveis de cinza e atributos de forma para analisar o formato dos corpos vertebrais. No total, 102 FVCs lombares (53 benignas e 49 malignas) e 89 corpos vertebrais lombares foram analisados. Após a aplicação de métodos de seleção de atributos nos vetores de características, foram realizadas classificações com os classificadores k-nearest-neighbor (k-NN), uma rede neural artificial com função de base radial (RBF network), naïve Bayes, J48 e Support Vector Machine (SVM). O padrão de referência para calcular o desempenho diagnóstico do sistema desenvolvido foi uma classificação obtida do prontuário médico eletrônico com o diagnóstico final de cada caso, incluindo no mínimo informações a respeito de xxi biópsia para as FVC lesões malignas e acompanhamento clínico e laboratorial para as FVCs benignas. Três radiologistas classificaram os mesmos casos analisando as mesmas regiões de interesse (ROIs) que os classificadores e uma comparação entre classificadores e radiologistas foi realizada. Resultados: Os resultados obtidos pelos classificadores mostraram uma área abaixo da curva receiver operating characteristic (AUROC) de 0,984 para distinguir entre corpos vertebrais com FVC e normais e AUROC de 0,930 para discriminar entre FVC benigna e FVC maligna. Conclusão: Nosso método alcançou ótimos resultados na classificação de corpos vertebrais sem fratura, corpos vertebrais com fratura por osteoporose e corpos vertebrais com fraturas secundárias a doença metastática. Nossos resultados foram estatisticamente equivalentes ao de médicos radiologistas e se mostraram promissores na assistência em diagnóstico de FVCs.
Titre en anglais
Semiautomatic classification of benign and malignant vertebral fractures in magnetic resonance imaging
Mots-clés en anglais
Computer aided diagnosis
Image processing
Magnetic resonance imaging, Vertebral compression fractures
Resumé en anglais
Purpose: Vertebral compression fractures (VCFs) result in partial collapse of vertebral bodies. They usually are nontraumatic or occur with low-energy trauma in the elderly secondary to different etiologies, such as insufficiency fractures of bone fragility in osteoporosis (benign fractures) or vertebral metastasis (malignant fractures). Our study aims to detect the presence of VCFs and classify them as malignant and benign using image processing techniques and machine learning classifiers in T1-weighted magnetic resonance images (MRI). Materials and methods: We used the median sagittal planes of lumbar spine MRIs from 63 patients (38 women and 25 men) previously diagnosed with VCFs. The lumbar vertebral bodies were manually segmented and statistical features of gray levels were computed from the histogram. We also extracted texture features to analyze the gray-level distribution, and shape features to analyze the contours of the vertebral bodies. In total, 102 lumbar VCFs (53 benign and 49 malignant) and 89 normal lumbar vertebral bodies were analyzed. After run feature selection methods to the vector of features, the k-nearest-neighbor (k-NN), neural network with radial basis functions (RBF network), a naïve Bayes classifier, J48, and Support Vector Machine (SVM) were used for classification. We compared the classification obtained by these classifiers with the final diagnosis of each case, including biopsy for the malignant fractures and clinical and laboratory follow up for the benign fractures. Furthermore, three voluntary radiologists classified the same cases analyzing the same regions of interests (ROIs) used by the classifiers and a comparison between the classifiers and the radiologists was done. xxiii Results: The results obtained by the classifiers showed an area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) of 0.984 in distinguishing between normal and fractured vertebral bodies, and AUROC of 0.930 in discriminating between benign and malignant VCFs. Conclusion: Our method reached great results in the classification of vertebral bodies without fractures, vertebral bodies with fractures due to osteoporosis and vertebral bodies with fractures due to metastatic diseases. Our results were statistically equivalent to the results of the classifications made by radiologists and they showed to be promising in diagnosis assisting of VCFs.
 
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Date de Publication
2018-02-16
 
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