• JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
 
  Bookmark and Share
 
 
Doctoral Thesis
DOI
https://doi.org/10.11606/T.17.2022.tde-08082022-110456
Document
Author
Full name
Hugo Alexandre de Araujo Barros Cobra
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
Ribeirão Preto, 2022
Supervisor
Committee
Salim, Rodrigo (President)
Garcia, Luis Vicente
Cury, Ricardo de Paula Leite
Luzo, Marcus Vinicius Malheiros
Title in Portuguese
Desenvolvimento de um teste rápido de quantificação de DNA livre para diagnóstico da infecção periprotética após artroplastia total de joelho
Keywords in Portuguese
Artroplastia total de joelho
Biomarcador
DNA livre
Infecção articular periprotética
Abstract in Portuguese
A infecção periprotética (PJI) é uma das complicações mais frequentes e graves da artroplastia total de joelho (ATJ). O diagnóstico preciso e o tratamento adequado são imprescindíveis para evitar a perda funcional e a evolução para infecção sistêmica. Entretanto, o diagnóstico correto da PJI ainda é um desafio ao cirurgião, uma vez que ainda não há um método de diagnóstico acurado e os critérios de diagnóstico existentes se baseiam em testes sorológicos, histológicos e microbiológicos que são imprecisos e demorados. Nos últimos anos, o DNA livre vem sendo estudado como biomarcador para diversas doenças como câncer, trombose e sepse. Este estudo tem como objetivo investigar o valor diagnóstico da quantificação de DNA livre na identificação da PJI. Para isso, foi realizado um estudo prospectivo com pacientes submetidos à cirurgia de revisão da ATJ, dos quais foi possível coletar líquido sinovial (LS) durante o procedimento cirúrgico. A quantificação de DNA livre foi realizada diretamente a partir do LS. A sensibilidade, especificidade e a curva receiver operating characteristic (ROC) foram calculadas. Foram incluídos no estudo 69 pacientes, dos quais 29 foram diagnosticados com PJI. A quantificação de DNA livre no líquido sinovial de pacientes com PJI foi significativamente maior no grupo infectado (124,8 ng/µL ± 56,6) que no grupo não infectado (4,6 ng/ml ± 2,8, p<0,0001). A área sob a curva receiver operating characteristic (AUC ROC) foi de 0,981 (IC 95% de 0,914 a 0,999). Para o ponto de corte de 15 ng/µL, a sensibilidade foi de 0,96 e a especificidade 1,0. Também foi avaliado um método rápido de quantificação de DNA livre, utilizando um fluorímetro portátil. Através deste método, os níveis de DNA livre também foram significativamente maiores no LS de pacientes com PJI (40,4 ± 14,5 vs 3,3 ± 2,5, p<0,0001). A AUC ROC foi de 0,955 (IC 95% de 0,687 a 0,992). Para o ponto de corte de 11 ng/µL, a sensibilidade foi de 0,96 e especificidade 1,0. A partir dos resultados apresentados, podemos concluir que a quantificação de DNA livre se mostrou um teste com elevada sensibilidade e especificidade para o diagnóstico da PJI.
Title in English
Development of a rapid cell-free DNA quantification test for diagnosing periprosthetic infection after knee arthroplasty
Keywords in English
Biomarker
Cell-free DNA
Periprosthetic joint infection
Total knee arthroplasty
Abstract in English
Periprosthetic joint infection (PJI) is one of the most frequent and devastating complications of total knee arthroplasty (TKA). Accurate diagnosis and proper treatment are essential to prevent functional loss and progression to systemic infection. However, the correct diagnosis of PJI is still a challenge since there is no accurate diagnostic method and the existing diagnostic criteria are based on serological, histological and microbiological tests that are imprecise and time-consuming. In recent years, cell-free DNA has been studied as a biomarker for several diseases such as cancer, thrombosis and sepsis. This study aims to investigate the diagnostic value of cell-free DNA quantification in identifying PJI. For this, we performed a prospective study with patients undergoing TKA revision surgery, from whom it was possible to collect synovial fluid (SF) during the surgical procedure. Cell-free DNA quantification was performed directly from the SF. Sensitivity, specificity, and the receiver operating characteristic (ROC) curve were calculated. Sixty nine patients were included in the study, 29 of whom were diagnosed with PJI. The quantification of cell-free DNA in the synovial fluid of patients with PJI was significantly higher in the infected group (124.8 ng/µl ± 56.6) than in the uninfected group (4.6 ng/ml ± 2.8, p<0 .0001). The area under the receiver operating characteristic curve (auc roc) was 0.981 (95% CI 0.914 to 0.999). For the cutoff point of 15 ng/µl, the sensitivity was 0.96, and specificity 1.0. A fast cell-free DNA quantification method using a portable fluorimeter was also evaluated. Through this method, cell-free DNA levels were also significantly higher in the SF of patients with PJI (40.4 ± 14.5 vs 3.3 ± 2.5, p<0.0001). The auc roc was 0.955 (95% CI 0. 687 to 0.992). For the cutoff point of 11 ng/µl, the sensitivity was 0.96, and specificity 1.0. From the results presented, we can conclude that cell-free DNA quantification proved to be a test with high sensitivity and specificity for the diagnosis of PJI.
 
WARNING - Viewing this document is conditioned on your acceptance of the following terms of use:
This document is only for private use for research and teaching activities. Reproduction for commercial use is forbidden. This rights cover the whole data about this document as well as its contents. Any uses or copies of this document in whole or in part must include the author's name.
Publishing Date
2022-08-15
 
WARNING: Learn what derived works are clicking here.
All rights of the thesis/dissertation are from the authors
CeTI-SC/STI
Digital Library of Theses and Dissertations of USP. Copyright © 2001-2024. All rights reserved.