Ondas internas com frequências maregráficas são denominadas marés internas. Essas ondas são geradas na quebra da plataforma continental pela interação entre a onda externa de maré e a topografia do fundo, num oceano verticalmente estratificado. Há indícios observacionais e de resultados de modelos numéricos de que marés Internas propagam-se em direção à costa, desde a quebra da plataforma continental, na Plataforma Continental Sudeste do Brasil, incluindo a região situada em torno da Ilha de São Sebastião. Uma das consequências dessa propagação é a intensificação dos processos de mistura vertical e consequente elevação da picnoclina em direção à superfície. Foi aplicado o modelo numérico ECOM para investigar a propagação das marés internas M² em direção à costa do litoral norte de São Paulo, com ênfase na região ao sul da Ilha de São Sebastião e a mistura vertical associada. Resultados mostraram dois regimes distintos de propagação de marés internas M² na PCSE, com principal local de geração na quebra da plataforma e na parte superior do talude, mais intenso ao sul da Ilha de São Sebastião e menos intenso ao norte da Ilha de São Sebastião, com intensidade das correntes próximas a das marés barotrópicas. As correntes de maré interna M² mais intensas foram encontradas nas proximidades da Ilha de São Sebastião. Nestes locais resultados mostraram eventos de mistura vertical intensos com frequência próxima a da componente de maré M².

Internal tides are tidal frequency internal waves and propagates within thewater column. These gravity waves are generated when barotropic tidal currents flow trough steep topographic gradient in a stratified fluid, creating mass instability and propagating energy. Internal tides were observed and modeled propagating towards the coast in Southeast Brazilian Bight, with intensification near São Sebastião Island. Internal tide amplitudes can reach up to 20 m, and the currents associated to them are comparable to the surface tidal currents. They enhance vertical shear and transport denser cold water to the surface, creating instability and leading to turbulence and mixing. Prognostic coastal hydrodynamic model (ECOM) simulations were analysed and compared with mooring and tide gauge data to study internal tides in the SBB, and latter in Sao Sebastiao Island. Results showed highly M² internal tides activity in the vicinity of Sao Sebastiao Island, and internal tides reaching 10 m, being stronger in summer and normaly generated over the continental shelf break and upper slope, and vertical mixing events oscilating with the same period of the M² internal tides.