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Tese de Doutorado
DOI
10.11606/T.42.2010.tde-07102010-121558
Documento
Autor
Nome completo
Lilian Walsh Keller
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2010
Orientador
Banca examinadora
Durigon, Edison Luiz (Presidente)
Berezin, Eitan Naaman
Castrignano, Silvana Beres
Mehnert, Dolores Ursula
Pinho, João Renato Rebello
Título em português
Epidemiologia e caracterização molecular do Erythrovirus humano em populações da América do Sul.
Palavras-chave em português
Biologia Molecular
Epidemiologia
Genótipos
Parvovírus
Seqüenciamento genético
Vírus
Resumo em português
O parvovírus humano B19 é um vírus não envelopado, que contém uma fita simples de DNA. Seu genoma é altamente conservado, com 98 a 99% de similaridade entre os isolados. Durante a última década, variantes do parvovírus B19, gênero Erythrovirus, foram descritas apresentando variabilidade genética de 11 a 14. Uma nova classificação foi proposta, dividindo o gênero em três diferentes genótipos (1, 2, 3a e 3b). Para avaliar a diversidade genética e o papel epidemiológico dos eritrovírus, 892 amostras brasileiras e chilenas, foram investigadas para a presença de DNA viral. As amostras positivas foram seqüênciadas e genotipadas através da analise da região VP1/VP2. Os resultados mostraram predominância do genótipo 1 (89 amostras), seguido do genótipo 3 (1 amostra), nas amostras brasileiras, enquanto que nas amostras chilenas, apenas o genótipo 1 foi observado (24 amostras). A única variante detectada, a amostra BR543, apresentou variabilidade de aproximadamente 13%, quando comparada ao B19, sendo classificada como genótipo 3, subtipo 3b.
Título em inglês
Epidemiology and molecular characterization of human Erythrovirus in South American populations.
Palavras-chave em inglês
Epidemiology
Gene sequencing
Genotype
Molecular biology
Parvovirus
Viruses
Resumo em inglês
Human Parvovirus B19 is a non-enveloped, ssDNA virus. The genome is highly conserved, showing 98 to 99% of nucleotide similarity between the isolates. During the last decade, parvovirus B19 variants, genus Erythrovirus, were described showing 11 to 14 %. A new classification was suggested, dividing the genus in three different genotypes (1, 2, 3a and 3b). To evaluate the epidemiology and the erythrovirus genetic diversity, 892 brazilians and chileans samples, were investigated for the virus DNA presence. The positive samples were sequenced and genotyped (VP1/VP2). The results showed the prevalence of genotype 1 (69 samples), followed by genotype 3 (1 sample), in the brazilians samples, and in the Chilean samples only genotype 1 was observed (24 samples). The variant detected, BR543, showed 13% of divergence when compared to B19, classified as genotype 3, subtype 3b.
 
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Data de Publicação
2010-10-28
 
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