Nesse trabalho desenvolvemos equações de estimação generalizadas para análise de dados com medidas repetidas em dois fatores. As equações foram concebidas segundo a proposta de Liang e Zeger (1986). O método não pressupõe o conhecimento da estrutura real de dependência entre as observações sob os fatores, no entanto utiliza uma matriz de correlação de trabalho a fim de modelar essa estrutura de dependência. Apresentamos estimadores consistentes para os parâmetros que modelam a média e para os parâmetros de correlação considerando-se sub-estruturas na matriz de correlação de trabalho. Apresentamos também rotina para o cálculo das estimativas desses parâmetros. Analisamos três conjuntos de dados e avaliamos a qualidade dos modelos ajustados por meio das técnicas de diagnóstico desenvolvidas por Venezuela et al. (2007).

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