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Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.45.2005.tde-20210729-141959
Document
Auteur
Nom complet
Said Sadique Adi
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2005
Directeur
Titre en portugais
Identificação de genes por comparação de seqüências
Mots-clés en portugais
Algoritmos E Estruturas De Dados
Resumé en portugais
Com os avanços das técnicas de sequenciamento das moléculas de DNA, nos deparamos atualmente com um número expressivo de seqüências genômicas a serem analisadas. Dentre as várias informações de interesse guardadas em uma seqüência desse tipo está a localização de cada um de seus genes. O problema da identificação de genes em seqüências eucarióticas continua em aberto mesmo após os avanços obtidos com o desenvolvimento de métodos e ferramentas computacionais dedicadas a ele. Nesse trabalho propomos três heurísticas distintas para a tarefa de localização dos genes em uma seqüência de DNA eucariótica. Todas elas se baseiam na comparação de duas ou mais seqüências genômicas. A primneira dessas heurísticas trata a tarefa de identificar os genes em uma seqüência de interesse comparando-a com uma seqüência de cDNA. Isso é feito por meio da busca por um alinhamento especial entre duas seqüências denominado alinhamento spliced. Na segunda heurística, abordamos o problema do alinhamento sintênico entre duas seqüências e sua aplicação na tarefa de identificação de genes. Por último, temos uma heurística que trata o problema da identificação de genes seguindo uma nova abordagem. Nela, várias seqüências genômicas são comparadas na busca pelos seus genes. A precisão de cada um dos nossos programas compara-se àquelas de outros programas de predição descritos na literatura.
Titre en anglais
not available
Resumé en anglais
not available
 
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AdiSaidSadique.pdf (21.02 Mbytes)
Date de Publication
2021-07-29
 
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