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Mémoire de Maîtrise
DOI
https://doi.org/10.11606/D.45.2008.tde-20220712-122819
Document
Auteur
Nom complet
Andrea Tieme Nakasato
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2008
Directeur
Titre en portugais
Ordenação por reversão.
Mots-clés en portugais
Algoritmos E Estruturas De Dados
Resumé en portugais
Muitos problemas em biologia computacional, especialmente aqueles envolvendo comparação de genomas, podem ser reduzidos a problemas clássicos em combinatória. Neste contexto, um genoma é representado por uma permutação sinalizada cujos elementos correspondem aos genes, e cujos sinais (+ ou -) indicam a direção de transcrição dos genes. Assim, genomas podem ser comparados simplesmente comparando-se as correspondentes permutações e operações em genomas podem ser definidos em termos de operações sobre permutações. Neste trabalho, estamos interessados no problema de comparar dois genomas determinando um cenário com o melhor número de operações de reversão que são necessárias para transformar um genoma em outro. Este problema, na linguagem de permutações, é um problema clássico conhecido como ordenação por reversão. Observamos que podemos supor que uma das permutações dadas é a identidade, e assim, podemos considerar que é dada apenas uma permutação e que o objetivo é transformá-la na permutação identidade, realizando o menor número de operações de reversão.
Titre en anglais
not available
Resumé en anglais
not available
 
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Date de Publication
2022-07-13
 
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