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Master's Dissertation
DOI
https://doi.org/10.11606/D.45.2008.tde-20220712-122819
Document
Author
Full name
Andrea Tieme Nakasato
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2008
Supervisor
Title in Portuguese
Ordenação por reversão.
Keywords in Portuguese
Algoritmos E Estruturas De Dados
Abstract in Portuguese
Muitos problemas em biologia computacional, especialmente aqueles envolvendo comparação de genomas, podem ser reduzidos a problemas clássicos em combinatória. Neste contexto, um genoma é representado por uma permutação sinalizada cujos elementos correspondem aos genes, e cujos sinais (+ ou -) indicam a direção de transcrição dos genes. Assim, genomas podem ser comparados simplesmente comparando-se as correspondentes permutações e operações em genomas podem ser definidos em termos de operações sobre permutações. Neste trabalho, estamos interessados no problema de comparar dois genomas determinando um cenário com o melhor número de operações de reversão que são necessárias para transformar um genoma em outro. Este problema, na linguagem de permutações, é um problema clássico conhecido como ordenação por reversão. Observamos que podemos supor que uma das permutações dadas é a identidade, e assim, podemos considerar que é dada apenas uma permutação e que o objetivo é transformá-la na permutação identidade, realizando o menor número de operações de reversão.
Title in English
not available
Abstract in English
not available
 
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Publishing Date
2022-07-13
 
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