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Master's Dissertation
DOI
https://doi.org/10.11606/D.45.2015.tde-20230727-113338
Document
Author
Full name
Leandro Ticlia De La Cruz
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2015
Supervisor
Title in Portuguese
Quanticação de angiogênese em imagens de membranas corioalantóicas de embrião de galinha
Keywords in Portuguese
Aprendizado Computacional
Neovascularização Fisiológica
Abstract in Portuguese
A angiogênese é um processo natural de formação de vasos sanguíneos a partir de uma vasculatura existente. Este fenômeno é controlado por diferentes fatores de estímulo e inibição. Perturbações no equilíbrio desses fatores podem ocasionar um crescimento descontrolado ou incompleto dos vasos, podendo estar relacionados a diferentes doenças. Para entender a ação e os efeitos de diferentes substâncias na ângiogênese, experimentos in vivo são realizados utilizando membranas corioalantóicas (CAM) de embrião de galinha. Para a quanticação da angiogênese, realizam-se análises da rede vascular dessas membranas em imagens obtidas por microscópios. As quanticações manuais podem ser cansativas, tediosas, demoradas e sujeitas a erros e variações subjetivas. Neste trabalho abordamos a questão da quanticação computacional de angiogênese em imagens da CAM. Investigamos diferentes medidas de quanticação existentes na literatura, e também propomos algumas novas medidas. A metodologia adotada consiste na segmentação dos vasos, realizada de forma semi-automática, a detecção de pontos de interesse na rede vascular, a classicação dos segmentos de vasos, e por m o cálculo das medidas. Na parte experimental, utilizamos um conjunto de imagens cedidas pelo Laboratório de Imunologia do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológi- cas da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP, sobre as quais aplicamos a metodologia adotada. Descrevemos e discutimos as correlações observadas entre a percepção visual e as medidas calculadas.
Title in English
Quantication of angiogenesis in chick embryo chorioallantoic membrane images
Abstract in English
Angiogenesis is the process of natural formation of blood vessels from pre-existing vascular network. This phenomenon is controlled by dierent angiogenesis stimulating and inhibiting factors. Perturbations of the equilibrium of these factors may cause a uncontrolled or incomplete growth of the vessels, being associated to several types of diseases. To understand the action and eects of dierent substances in angiogenesis, in vivo experiments are performed using chick embryo chorioallantoic membrane (CAM). To quantify angiogenesis, the vascular network in these membranes are analyzed from images obtained by means of a microscopy. Manual quantication may be tiring, tedious, time consuming, and prone to errors and subjective variations. In this work we address the issue of computational quantication of angiogenesis in CAM images. We investigate dierent quantication measures reported in the related literature and also propose some new measures. The adopted methodology consists of vessel segmentation, performed in a semi-automatic way, detection of points of in- terest in the vascular network, classication of vessel segments, and at last the computation of the measures. In the experimental part, we use a set of images provided by the Laboratório de Imunologia of Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas of USP, which are processed by the proposed methodology. We describe and discuss the correlations observed between visual perception and computed measures.
 
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Publishing Date
2023-07-27
 
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