O trabalho descreve um método para isolamento de núcleos morfologicamente intacto e fisiologicamente ativos, além da caracterização parcial do DNA de Acanthamoeba castellanii (linhagem Neff). O DNA celular total de trofozoitos contém quatro famílias com diferentes velocidades de renaturação. A fração com renaturação mais lenta (DNA "único"), corresponde ao DNA nuclear (86% do genoma) e apresenta características cinéticas compatíveis com uma complexidade de sequência igual a 1,46x10¹¹ daltons. O DNA reiterado (14% do genoma), compreende três famílias de sequências de nucleotídeos, denominadas "rápidas", "intermediária" e "lenta", com complexidade cinética respectivamente igual a 1,5x10⁶; 2,1x10 e 2,6x10⁸ daltons, presentes em aproximadamente 3x10³, 3x10² e 50 cópias. As famílias de DNA reiterado têm localização predominantemente citoplasmática, sendo que as famílias "intermediárias" e "lentas" fazem parte do genoma mitocondrial. O comportamento cinético heterogêneo do DNA mitocondrial e sua complexidade assemelham-se aos dados existentes para outros microrganismos eucariotos. A constatação de uma espécie de DNA extramitocondrial pode ser relacionada com a descrição anterior de corpúsculos citoplasmáticos contendo DNA ou com a extrusão de cromatina para o citoplasma, verificada no início do encistamento. O DNA de trofozoitos também foi caracterizado quanto ao padrão de sedimentação em gradientes de densidade, desnaturação térmica e composição de bases. O DNA celular total apresenta dois componentes em gradientes de CsCl, caracterizados por densidade de flutuação iguais a 1,717 g/cm³ (Componente maior) e 1,692 g/cm³ (componente menor). O perfil de fusão do DNA mitocondrial sugere heterogeneidade de composição de bases.