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Tese de Doutorado
DOI
10.11606/T.46.2011.tde-28052012-100927
Documento
Autor
Nome completo
Márcia Cristina Teixeira dos Santos
E-mail
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2011
Orientador
Banca examinadora
Oliveira, Carla Columbano de (Presidente)
Castilho, Beatriz Amaral de
Gomes, Suely Lopes
Valentini, Sandro Roberto
Verjovski-Almeida, Sergio
Título em português
Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
Palavras-chave em português
Complexo TRAMP
Controle de qualidade de RNA
Exossomo
Nip7p
Nop8p
Processamento de rRNA
RNA
Resumo em português
A proteína nucleolar Nop8p de levedura foi identificada inicialmente através de sua interação com Nip7p e está envolvida na formação da subunidade ribossomal 60S. A depleção de Nop8p em células de levedura leva à degradação prematura dos rRNAs, porém o mecanismo bioquímico responsável por este fenótipo ainda não é conhecido. Neste trabalho, mostramos que a interação de Nop8p com o rRNA 5.8S se dá através de sua região amino-terminal, enquanto que a porção carboxi-terminal é responsável pela interação com Nip7p e complementa parcialmente o defeito no crescimento observado na cepa mutante condicional Δnop8/GAL::NOP8. Além disso, Nop8p media a associação de Nip7p com as partículas pré-ribossomais. Nop8p também interage com a subunidade Rrp6p do exossomo e inibe a atividade do complexo in vitro, sugerindo que a diminuição dos níveis da subunidade ribosomal 60S detectada após a depleção de Nop8p pode ser resultado da degradação dos pré-rRNAs pelo exossomo. Estes resultados indicam que Nop8p pode regular a atividade do exossomo durante o processamento do pré-rRNA.
Título em inglês
Functional characterization of the Saccharomyces cerevisiae nucleolar protein Nop8p
Palavras-chave em inglês
Exosome
Nip7p
Nop8p
RNA
RNA-surveillance
rRNA processing
TRAMPcomplex.
Resumo em inglês
The yeast nucleolar protein Nop8p has previously been shown to interact with Nip7p and to be required for 60S ribosomal subunit formation. Although depletion of Nop8p in yeast cells leads to premature degradation of rRNAs, the biochemical mechanism responsible for this phenotype is still not known. In this work, we show that the Nop8p amino-terminal region mediates interaction with the 5.8S rRNA, while its carboxylterminal portion interacts with Nip7p and can partially complement the growth defect of the conditional mutant strain Δnop8/GAL::NOP8. Interestingly, Nop8p mediates the association of Nip7p to pre-ribosomal particles. Nop8p also interacts with the exosome subunit Rrp6p and inhibits the complex activity in vitro, suggesting that the decrease in 60S ribosomal subunit levels detected upon depletion of Nop8p may result from degradation of pre-rRNAs by the exosome. These results strongly indicate that Nop8p may control exosome function during pre-rRNA processing.
 
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Data de Publicação
2012-07-06
 
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