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Master's Dissertation
DOI
Document
Author
Full name
Cássia Docena
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2000
Supervisor
Committee
Quaggio, Ronaldo Bento (President)
Araujo, Pedro Soares de
Gruber, Arthur
Title in Portuguese
Seqüenciamento e anotação de parte do genoma de Xylella fastidiosa e análise das vias de bissíntese de pequenas moléculas e cofatores
Keywords in Portuguese
Biologia molecular
Bioquímica
Biossíntese de aminoácidos
Microbiologia
Projeto genoma
Abstract in Portuguese
Agente da clorose variegada dos Citrus (CVC) ou amarelinho, Xylella fastidiosa, uma bactéria gram-negativa limitada ao xilema, tem grande importância na agricultura do Estado de São Paulo. Identificada em 1987, na região de Bebedouro, a CVC já está presente em quase todas as áreas citrícolas do país, afetando a produção de frutos e seus derivados. O projeto genoma, criado pela FAPESP em 1997 com o apoio do FUNDECITRUS, habilitou laboratórios da capital e interior paulistas a seqüenciar o genoma deste fitopatógeno, contribuindo internacionalmente para a elucidação de sua completa informação genética. Nosso laboratório (QR) obteve aproximadamente 1.900 leituras de bibliotecas aleatórias de "shotgun". Seqüenciamos 13 cosmídeos perfazendo um total linear de 533.571 pares de bases. Anotamos 125 genes prováveis de cinco cosmídeos e realizamos a análise de uma categoria dos genes anotados, referente à biossíntese de pequenas moléculas, onde incluem-se a biossíntese de aminoácidos, purinas e pirimidinas, ácidos graxos, poliaminas, cofatores, grupos prostéticos e transportadores de elétrons. X. fastidiosa possui, mesmo que incompletas, as vias metabólicas para a produção de todos os aminoácidos, sendo provavelmente a glutamina, o principal meio para a obtenção de nitrogênio. Estão presentes as vias para a biossíntese de ribonucleotídeos de purina e pirimidina. X. fastidiosa parece conseguir elongar ácidos graxos a partir de acetil-CoA e é capaz de sintetizar uma grande variedade de cofatores e grupos prostéticos, entretanto, estão ausentes os genes envolvidos na biossíntese de biotina, cobalamina e enterobactina.
Title in English
Sequencing and annotation of part of the genome of Xylella fastidiosa and analysis of the bissynthesis pathways of small molecules and cofactors
Keywords in English
Amino acid biosynthesis
Biochemistry
Genome design
Microbiology
Molecular biology
Abstract in English
Abstract not available.
 
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Publishing Date
2019-05-31
 
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