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Doctoral Thesis
DOI
10.11606/T.46.2013.tde-22042013-113614
Document
Author
Full name
Thiago Carita Correra
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2013
Supervisor
Committee
Nigra, Jose Manuel Riveros (President)
Braga, Ataualpa Albert Carmo
Brito, Arnaldo Naves de
Klachquin, Graciela Arbilla de
Livotto, Paolo Roberto
Title in Portuguese
Da fase gasosa à solução: reatividade e estrutura de ésteres e funções análogas de Si, N, S e espectroscopia de íons solvatados em fase gasosa
Keywords in Portuguese
Espectroscopia
Fase gasosa
FT-ICR
IRMPD
Reatividade
Solvatação
Abstract in Portuguese
A presente tese tem por objetivo inicial estudar a reatividade de ésteres de Si, N, S e seus análogos em fase gasosa para obter informações detalhadas do mecanismo destas espécies quando submetidas a ataque nucleofílico, sobretudo no que tange a competição entre as vias de substituição nesses centros e no carbono. Esses estudos são realizados experimentalmente através da técnica de espectrometria de massas por transformada de Fourier e ressonância ciclotrônica de íons (FT-ICR) e amparados por cálculos de estrutura eletrônica. Os resultados obtidos indicam que, para o Si, as alcoxissilanas reagem com os nucleófilos através de um aduto pentacoordenado que desloca, preferencialmente, um alcóxido. De forma minoritária, pode ocorrer o deslocamento de outro ligante gerando silóxidos ou carbânions. Neste estudo, foi caracterizada uma reação inédita de troca de Me por F nos silóxidos mediada por NF3. Os estudos dos ésteres de nitrogênio indicam que as reações de eliminação são mais favoráveis que as de substituição e que a substituição no nitrogênio, apesar de ser considerada mais favorável pelos cálculos, não é observada. Esse comportamento foi elucidado através do uso de dinâmica molecular e indica que o complexo de entrada para a via de reação no nitrogênio não é formado devido à repulsão sofrida pelo nucleófilo pelos oxigênios que rodeiam o centro de N. Resultados teóricos semelhantes foram encontrados para os ésteres de enxofre e, em adição aos resultados experimentais disponíveis, indicam que não só a dinâmica de reação exerce um papel importante nesses sistemas, como também sugerem uma compensação entre o caráter dinâmico e a termoquímica destes sistemas. Para nucleófilos fracos que não são favoráveis do ponto de vista termoquímico, a formação do complexo de entrada não é impedida pela repulsão, dado que esses nucleófilos não costumam ter centros nucleofílicos com carga muito localizada. O oposto ocorre com nucleófilos fortes, que procederiam pelo caminho de substituição no S por uma via praticamente sem barreira, mas não o fazem já que a repulsão do nucleófilo é muito intensa. Em uma segunda etapa a solvatação dos íons F-, Br- e I- foram estudadas na fase gasosa a partir da espectroscopia dissociação no infravermelho. A partir da formação por uma fonte de eletrospray de agregados altamente solvatados, foi possível determinar o efeito dos íons na organização das moléculas de solvente, determinar a mudança da solvatação interna para solvatação de superfície e determinar o número de hidratação em fase gasosa para os íons Br- e F-. Além disso, tanto os resultados experimentais quanto teóricos mostram que a natureza do íon influencia a primeira camada de solvatação e que a carga formal tem um efeito predominante em longo alcance, podendo organizar até centenas de moléculas de solventes. Por fim, realizamos a adaptação do sistema de aquisição do FT-ICR do laboratório. Isso não só confere um sistema atualizado ao nosso instrumento, como possibilita que novos experimentos, como a espectroscopia de íons, possam ser realizados no nosso grupo de pesquisa.
Title in English
From the gas-phase to solution: gas-phase reactivity and structure of Si, N and S esters and their analogs and spectroscopy of gas-phase solvated ions.
Keywords in English
FT-ICR
Gas-phase
IRMPD
Reactivity
Solvation
Spectroscopy
Abstract in English
This thesis comprises the study of the reactivity of gas-phase ions in the gas-phase and the structural modifications observed for gas-phase ions as a function of progressive solvation by spectroscopic techniques. In the first part, we describe the gas-phase reactivity of Si, N, and S esters and their analogs towards simple nucleophiles and a detailed analysis of the competition between different reaction channels namely substitution vs. elimination. These studies were carried out by Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (FT-ICR) and supported by theoretical calculations. Our results suggest that alkoxysilanes react with nucleophiles via a pentacoordinated adduct that results in alkoxide displacement as the major reaction channel. The displacement of other ligands can also occur to yield siloxides or carbanions. As part of these studies, we also report a Me/F exchange reaction in siloxide ions mediated by NF3. Results obtained for the nitrogen esters show elimination-type reactions to be the most favorable pathway followed by nucleophilic displacement. No displacement was observed at the nitrogen center in spite of the fact that calculations predict this channel to be the most favorable pathway. This behavior was further explored by ab initio molecular dynamics calculations that show that the entrance complex for the nitrogen pathway is avoided because of the strong electrostatic repulsion exerted by the oxygen atoms as the nucleophile approaches the N center. Similar theoretical results were obtained for the sulfur esters. Comparison of these calculations with the experimental results also suggests that the reaction dynamics play an important role in these systems. Furthermore, we propose that a combination of thermochemical and dynamic balance hinders substitution at the heteroatom. For strong nucleophiles that could undergo substitution at the S center via a barrierless pathway, the reaction is hindered by the strong repulsion experienced by these nucleophiles. In the second part, we study the structure of gas-phase solvated F-, Br- and I- by infrared dissociation spectroscopy. The highly solvated clusters were generated by electrospray ionization and their structures probed to gather information regarding the short and long-range effect of these ions on the solvation network. Solvation parameters such as the number of water molecules needed for a switch from internal to surface solvation and the hydration numbers for F- and Br- were determined. Theoretical and experimental results show that the solvation pattern of the first solvation shell for these ions depends on the nature of the ion while the ion charge prevails in determining the long-range pattern. This pattern effect is shown to prevail up to hundreds of solvent molecules. Finally, a new data acquisition and control system is described for our FT-ICR spectrometer. This system not only updates the original instrument but it also brings in new capabilities to the spectrometer such as the ability to carry out gas-phase ion dissociation spectroscopy.
 
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corrigidaTCC2013.pdf (7.36 Mbytes)
Publishing Date
2013-06-04
 
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  • CORRERA, Thiago C., and RIVEROS, José M.. Gas-Phase Nucleophilic and Elimination Reactions in Simple Alkyl Nitrates [doi:10.1021/jp107500s]. The Journal of Physical Chemistry A [online], 2010, vol. 114, n. 44, p. 11910-1191.
  • CORRERA, Thiago C., and RIVEROS, José M.. Gas-phase reactivity of sulfate esters and analogs : why is the sulfur center unreactive? [doi:10.1016/j.ijms.2013.07.008]. International Journal of Mass Spectrometry [online], 2013.
  • CORRERA, Thiago C., and RIVEROS, José M.. Sequential Methyl-Fluorine Exchange Reactions of Siloxide Ions in the Gas Phase [doi:10.1002/anie.201203970]. Angewandte Chemie International Edition [online], 2012, vol. 51, n. 34, p. 8632-8635.
  • CORRERA, Thiago C., XAVIER, Luciano A., and RIVEROS, José M.. Gas-Phase Nucleophilic Reactivity of Alkoxysilanes [doi:10.5935/0103-5053.20130033]. Journal of the Brazilian Chemical Society [online], 2013, vol. 24, n. 2, p. 256-265.
  • CORRERA, Thiago Carita, and FRANK, André de Carvalho. A Equação-Mestra : atingindo o equilíbrio [doi:10.1590/S0100-40422011000200032]. Química Nova [online], 2011, vol. 34, n. 2, p. 346-353.
  • DE SOUZA, Miguel A. F., et al. Selectivity and Mechanisms Driven by Reaction Dynamics : The Case of the Gas-Phase OH [doi:10.1021/ja3057166]. Journal of the American Chemical Society [online], 2012, vol. 134, n. 46, p. 19004-1901.
  • PRELL, James S., et al. Entropy Drives an Attached Water Molecule from the C- to N-Terminus on Protonated Proline [doi:10.1021/ja106167d]. Journal of the American Chemical Society [online], 2010, vol. 132, n. 42, p. 14733-1473.
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