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Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.95.2008.tde-20230725-114549
Document
Auteur
Nom complet
Luiz Carlos da Silva Rozante
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2008
Directeur
Titre en portugais
Modelos discretos para sistemas de sinalização celular baseados no contato célula-célula
Mots-clés en portugais
Bioinformática
Resumé en portugais
Sinalização justácrina é um tipo de sinalização celular, no qual tanto o receptor do sinal (geralmente uma proteína) quanto o ligante (também geralmente uma proteína, responsável pela ativação do receptor) estão ancorados nas membranas plasmáticas, de modo que nesse tipo de sinalização a ativação do receptor depende do contato direto entre as membranas das células envolvidas. Sinalização justácrina está presente em diversos e importantes eventos celulares de vários organismos, em especial no processo de desenvolvimento. Propomos um modelo formal genérico (um framework de modelagem) para sistemas de sinalização justácrina, que é uma classe de sistemas dinâmicos discretos. Ele possui características desejáveis em um bom framework de modelagem, tais como: a) similaridade estrutural com modelos biológicos normalmente utilizados, b) capacidade de representação modular de sistemas de sinalização, c) capacidade de operar em diferentes escalas de tempo e d) capacidade de tratar explicitamente tanto os eventos e elementos moleculares que ocorrem na membrana, quanto aqueles que ocorrem no meio intracelular e que estão envolvidos no processo de sinalização justácrina. Propomos um método para identificação de padrões celulares, modulados por interações justácrinas, via o cálculo de atratores em uma subclasse desse framework constituída de sistemas dinâmicos discretos finitos. Desenvolvemos um software de suporte a modelagem e à análise de sistemas de sinalização justácrina neste framework que incorpora o método proposto de identificação de padrões celulares.
Titre en anglais
not available
Resumé en anglais
not available
 
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Date de Publication
2023-07-27
 
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