Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.95.2008.tde-20230725-114549
Document
Auteur
Nom complet
Luiz Carlos da Silva Rozante
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Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2008
Directeur
Titre en portugais
Modelos discretos para sistemas de sinalização celular baseados no contato célula-célula
Mots-clés en portugais
Bioinformática
Resumé en portugais
Sinalização justácrina é um tipo de sinalização celular, no qual tanto o receptor do sinal (geralmente uma proteÃna) quanto o ligante (também geralmente uma proteÃna, responsável pela ativação do receptor) estão ancorados nas membranas plasmáticas, de modo que nesse tipo de sinalização a ativação do receptor depende do contato direto entre as membranas das células envolvidas. Sinalização justácrina está presente em diversos e importantes eventos celulares de vários organismos, em especial no processo de desenvolvimento. Propomos um modelo formal genérico (um framework de modelagem) para sistemas de sinalização justácrina, que é uma classe de sistemas dinâmicos discretos. Ele possui caracterÃsticas desejáveis em um bom framework de modelagem, tais como: a) similaridade estrutural com modelos biológicos normalmente utilizados, b) capacidade de representação modular de sistemas de sinalização, c) capacidade de operar em diferentes escalas de tempo e d) capacidade de tratar explicitamente tanto os eventos e elementos moleculares que ocorrem na membrana, quanto aqueles que ocorrem no meio intracelular e que estão envolvidos no processo de sinalização justácrina. Propomos um método para identificação de padrões celulares, modulados por interações justácrinas, via o cálculo de atratores em uma subclasse desse framework constituÃda de sistemas dinâmicos discretos finitos. Desenvolvemos um software de suporte a modelagem e à análise de sistemas de sinalização justácrina neste framework que incorpora o método proposto de identificação de padrões celulares.
Titre en anglais
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Resumé en anglais
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Date de Publication
2023-07-27
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