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Thèse de Doctorat
DOI
Document
Auteur
Nom complet
Omar Julio Sosa
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2019
Directeur
Jury
Reis, Eduardo Moraes Rego (Président)
Brentani, Helena Paula
Kimura, Edna Teruko
Krepischi, Ana Cristina Victorino
Silva, Israel Tojal da
Titre en portugais
Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático
Mots-clés en portugais
Câncer pancreático
RNA-Seq
Transcritômica
Resumé en portugais
Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína.
Titre en anglais
Identification and functional annotation of novel transcripts with altered expression in pancreatic cancer
Mots-clés en anglais
Pancreatic cancer
RNA-Seq
Transcriptomic
Resumé en anglais
In the present work, we applied a bioinformatic pipeline to process and analyse data from total RNA-seq strand-oriented generated in our laboratory from matched samples of tumor and non-tumor adjacent pancreatic tissue from 14 patients with the goal of generate a high resolution catalog of the composition and the alterations in the transcriptome of PDAC, including protein coding and non coding genes.
 
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Date de Publication
2019-04-30
 
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