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Tese de Doutorado
DOI
Documento
Autor
Nome completo
Omar Julio Sosa
E-mail
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2019
Orientador
Banca examinadora
Reis, Eduardo Moraes Rego (Presidente)
Brentani, Helena Paula
Kimura, Edna Teruko
Krepischi, Ana Cristina Victorino
Silva, Israel Tojal da
Título em português
Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático
Palavras-chave em português
Câncer pancreático
RNA-Seq
Transcritômica
Resumo em português
Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína.
Título em inglês
Identification and functional annotation of novel transcripts with altered expression in pancreatic cancer
Palavras-chave em inglês
Pancreatic cancer
RNA-Seq
Transcriptomic
Resumo em inglês
In the present work, we applied a bioinformatic pipeline to process and analyse data from total RNA-seq strand-oriented generated in our laboratory from matched samples of tumor and non-tumor adjacent pancreatic tissue from 14 patients with the goal of generate a high resolution catalog of the composition and the alterations in the transcriptome of PDAC, including protein coding and non coding genes.
 
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Data de Publicação
2019-04-30
 
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