Tese de Doutorado
Documento
Tese de Doutorado
Autor
Sosa, Omar Julio
(
)
Nome completo
Omar Julio Sosa
E-mail
Unidade da USP
Interunidades em Bioinformática
Área do Conhecimento
Data de Defesa
2019-02-27
Imprenta
São Paulo, 2019
Orientador
Setubal, João Carlos - (Coorientador)
(
)
Banca examinadora
Reis, Eduardo Moraes Rego (Presidente)
Brentani, Helena Paula
Kimura, Edna Teruko
Krepischi, Ana Cristina Victorino
Silva, Israel Tojal da
Título em português
Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático
Palavras-chave em português
Câncer pancreático, RNA-Seq, Transcritômica
Resumo em português
Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína.
Título em inglês
Identification and functional annotation of novel transcripts with altered expression in pancreatic cancer
Palavras-chave em inglês
Pancreatic cancer, RNA-Seq, Transcriptomic
Resumo em inglês
In the present work, we applied a bioinformatic pipeline to process and analyse data from total RNA-seq strand-oriented generated in our laboratory from matched samples of tumor and non-tumor adjacent pancreatic tissue from 14 patients with the goal of generate a high resolution catalog of the composition and the alterations in the transcriptome of PDAC, including protein coding and non coding genes.
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Data de Publicação
2019-04-30
Trabalhos decorrentes
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