Nas últimas décadas, dados relacionados com a saúde humana, desde informações clínicas e epidemiológicas até imagens médicas e experimentos ômicos, foram gerados e acumulados em uma quantidade sem precedentes na história. Um campo novo de pesquisa chamado "Imunologia de Sistemas" emergiu para tentar integrar, analisar, interpretar e predizer os mecanismos moleculares de doenças e vacinas. Esta tese mostra diversas aplicações da Imunologia de Sistemas no estudo de arboviroses, vacina da gripe, câncer, tuberculose, pneumonia, artrite, dentre outros. Também mostra o desenvolvimento de ferramentas computacionais amigáveis que permitem com que qualquer cientista, sem conhecimento prévio de bioinformática, possa realizar análises de Imunologia de Sistemas. Os achados das análises forneceram novas hipóteses e insights que, ao serem testados e validados experimentalmente, melhoram nosso entendimento sobre os processos imunológicos por trás da vacinação e de doenças humanas.

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